Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndst1Q3UHN9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms