Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms