Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nom1Q3UFM5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nom1Q3UFM5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms