Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trafd1Q3UDK1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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