Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn7l3bQ3UD01 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms