Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pid1Q3UBG2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms