Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LbrQ3U9G9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms