Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Cops9Q3U898 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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