Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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