Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms