Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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