Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms