Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms