Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy4Q3TYX8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms