Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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