Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc136Q3TVA9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms