Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms