Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam107bQ3TGF2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Fam107bQ3TGF2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fam107bQ3TGF2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fam107bQ3TGF2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fam107bQ3TGF2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fam107bQ3TGF2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam107bQ3TGF2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms