Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms