Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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