Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccbe1Q3MI99 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms