Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms