Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom4Q1W617 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom4Q1W617 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom4Q1W617 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom4Q1W617 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom4Q1W617 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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