Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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