Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms