Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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