Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms