Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms