Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms