Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms