Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms