Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms