Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ncf1Q09014 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms