Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MitfQ08874 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms