Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms