Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms