Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms