Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms