Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms