Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Cab39Q06138 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Cab39Q06138 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cab39Q06138 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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