Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dcst1Q059Y8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dcst1Q059Y8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dcst1Q059Y8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dcst1Q059Y8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dcst1Q059Y8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms