Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms