Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox9Q04887 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox9Q04887 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox9Q04887 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms