Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms