Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms