Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CkbQ04447 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms