Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms