Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl7Q03366 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms