Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms