Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlh1Q02576 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms